Za svoj vynikajúci herecký výkon v tejto epizóde bola Gillian Andersonová v roku 1996 nominovaná na cenu Emmy za najlepší ženský herecký výkon v hlavnej úlohe v dramatickom seriáli.

"V 'Piper Maru' sa objavujú dve veci, ktoré mal Chris premyslené už dlhšie," hovorí spoluscenárista Frank Spotnitz. "Už dávno chcel nakrútiť scénu, v ktorej potápač vo skafandri pre ponory do tej najväčšej hĺbky objaví na dve mora lietadlo z druhej svetovej vojny a v ňom ešte žijúceho pilota. Tá predstava ho skrátka zaujala bez toho, aby uvažoval o tom, ako by to bolo možné a ako by sa to dalo vysvetliť a či ten pilot naozaj žije, alebo je to len potápačova halucinácia. Okrem toho Chris chcel nakrútiť niečo o čiernobielom svete na palube ponorky.

Takže z toho som vychádzal a snažil som sa o tom napísať ďalšiu epizódu seriálu. Niekoľkokrát som začal písať už vtedy, keď sme dokončili epizódu '731', ale nedarilo sa mi to. Nakoniec som sa chytil, keď som sa vracal lietadlom zo stretnutia fanúšikov v Minneapolise. Ale nemal som so sebou žiadny papier, iba pero a časopis, ktorý mi dali v lietadle. Počas toho letu mi prišlo na um, že sestra Scullyovej je už niekoľko mesiacov po smrti a my sme s tým zatiaľ nič nerobili. Smrť, áno, o tom bude tento príbeh, povedal som si. Začal som premýšľať o Scullyovej a Mulderovi a spomenul som si aj na Kryceka. Potom to už šlo ľahko a popísal som v tom časopise každé voľné miesto. Epizóda 'Piper Maru' následne prišla veľmi rýchlo na svet a tie úvahy o smrti sa pekne skĺbili s tým Chrisovým nápadom, tajomstvom potopeným na dne mora. Tam v mori sa stalo niečo príšerné a ľudia, ktorí sa s tým stretli, si to v sebe ponesú po zvyšok svojich životov. Toto je ústredná téma oboch epizód ('Piper Maru' a 'Apokryfy'). Odtiaľ pramení aj tá pekná scéna so živým Krycekom v raketovom sile na konci epizódy 'Apokryfy'.

Rob Bowman nakrúcal prvú epizódu a bolo tam obrovské množstvo záberov pod vodou. Boli to veľmi komplikované sekvencie, hoci sme mali k dispozícii nádrž a v nej lietadlo, ktoré zaistil vedúci výroby, a potápača. Bolo to veľmi komplikované. Nakrúcali sme vodu a dym a realizovali každý trik, ktorý bol v scenári. Pre mňa bolo úžasné najmä to, že sme to celé napísali v Los Angeles a potom sme odišli do Vancouveru a počas ôsmich pracovných dní sa to natočilo. Toto ma nikdy neprestane udivovať. Bola to obrovská operácia, štáb postavil všetky dekorácie, zaobstaral všetky rekvizity a vytipoval exteriéry. Štáb odviedol poriadny kus práce, ale tí ľudia ju robia týždeň čo týždeň."

Režisér Rob Bowman je nadšený: "Epizódu 'Piper Maru' nám zoslalo samo nebo. Čiastočne ten nápad vznikol vtedy, keď som sa po prvýkrát v noci potápal s akvalungom. Všetko sa strácalo v čiernej temnote, videl som len malé svetielka na nádržiach a svetlo z bateriek. Bol to mimoriadny zážitok a vtedy mi zišlo na um, že by sme mohli nakrútiť jednu epizódu o tom, ako potápači pod vodou objavia niečo naozaj desivé. Zmienil som sa o tom Chrisovi. Zaujalo ho to a dodal - nájdu tam lietadlo aj s pilotom. Tak teda vzniklo jadro tohto príbehu, od ktorého sme odvodili všetko ostatné. Je to epizóda, v ktorej má Mulder veľa mytologických scén. Emocionálne vyvážená je tiež dejová línia Scullyovej. A vôbec je to po všetkých stránkach obrovské predstavenie."

Pre Bowmana bola zaujímavá aj tá scéna, v ktorej sa Scullyová v myšlienkach vracia do minulosti, keď navštívi miesto, kde vyrastala, a spomína, ako sa hrala so svojou sestrou. "Nakrúcali sme to najskôr bez tých dievčat. Šli sme ulicou a slnko práve nesvietilo. Čakali sme, kým sa objaví. Sedel som na zadnom sedadle a dával pokyny kamere, ktorá bola za Gillian. Hovorím jej: 'Teraz to nakrútime. Tam vpravo pred tebou je strom, predstav si namiesto stromu svoju sestru.' Gillian mala vyjadriť svoju sesterskú náklonnosť a lásku, pričom hľadela na strom. Keď som si pozrel nafilmované zábery, zavolal som Gillian a hovorím: 'Si hviezda! Nikto by nepovedal, čo všetko dokážeš, a ja poviem každému, koho stretnem, čo si s tým stromom dokázala.' O dva týždne neskôr sa na rovnaké miesto vrátil náš pomocný štáb a nakrútil to s tými dievčatami. Potom sme zábery spojili a každý, kto ich uvidí, môže len povedať - no páni.

Pokiaľ ide o mytológiu seriálu, tu sme opäť pokročili trochu vpred a vyzerá to celkom prirodzene. Na konci epizódy '731' je divák z toho, čo všetko povedala Scullyová Mulderovi, trochu zmätený. V 'Piper Maru' je všetko jasné, tu sú skutočne mimozemšťania. Tiež sa mi páčil záver epizódy, v ktorom Krycek vychádza z toalety a spolu s Mulderom prejde okolo kamery. Cítim, že niečo nie je v poriadku. David sa pýta: 'Cítiš sa lepšie?' Nick Lea mu odpovedá: 'Ako nový človek.' Potom odídu zo záberu a epizóda sa končí. Lenže ja mám stále pocit, že tam niečo chýba. Čo by som mal urobiť? Odchádzam za kameru. Samozrejme, že sme s nakrúcaním pozadu, a tak na mňa každý hľadí a ja v duchu počujem - Rob, na toto už nemáme čas. Ale nakrúcame to ešte raz. Spomeniem si na jeden film, v ktorom je tiež taký dlhý záber chôdze, a mne príde na um, že ten náš záber je skrátka príliš dlhý, malo by sa tam ešte niečo stať. Hovorím Nickovi, aby šiel proti kamere. Nick vyskočí, ide priamo proti kamere a hľadí priamo do nej. Odstupujem od kamery a hovorím: 'Konečne máme posledný záber.' Potom som už len požiadal Mata Becka, aby hercove oči trikovo prekryl tou čiernou olejovitou látkou, čo má naznačiť, že v Krycekovom tele je v skutočnosti mimozemšťan. Takže v okamihu sme z toho čertovského záveru urobili záver, ktorý patrí medzi moje najobľúbenejšie."

Gillian Andersonová túto epizódu považuje za jednu z emocionálne najzložitejších epizód tretej série. "'Piper Maru' bola náročná," hovorí a poukazuje na scénu s veliteľom, ktorá Scullyovú prinútila vyrovnať sa s pocitom straty sestry a detstva. "Bolo treba zahrať minulosť aj prítomnosť súčasne."